Schumacher bizonyította tehetségét Szuzukában, ahol fantasztikusan teljesített az időmérő előtti utolsó szabadedzésen. A német versenyző legnagyobb riválisa, Fernando Alonso csak az ötödik pozícióban landolt. A Renault spanyol sofőrje előtt a Honda titánja, Jenson Button és csapattársa, Giancaro Fisichella végzett.

A hétvégén első alkalommal a pálya hőmérséklete harminc fok fölé kúszott, ugyanis napsütés fogadta a versenyzőket a szombat reggeli tréningen. Az elmúlt két nap esőzései után az aszfalt is felszáradt, viszont a szél igencsak felkerekedett, mely több csapatnak is nehézséget okozott a reggeli edzésen.

A Super Aguri japán versenyzője, Takuma Szato hajtott ki elsőként a pályára, akit Jarno Trulli, Christijan Albers, Ralf Schumacher, Nico Rosber, majd a Ferrari versenyzői váltottak az élen. Húsz perc után Felipe Massa volt a leggyorsabb. A brazil pilóta tíz percig uralta a mezőnyt, mikor jött csapattársa, Michael Schumacher és elsőként átlépve az 1:33-as időhatárt, átvette tőle a vezetést.

A Ferrari legnagyobb ellenfele, a Renault csak az edzés második felében kezdte meg a munkát. A franciák versenyzői első gyorskörükön a negyedik, illetve a hetedik időt autózták. Eközben a Toyota német pilótája, Ralf Schumacher váratlanul átvette a vezetést, miután egy parádés, 1:31-es kört teljesített - mely többeket ledöbbentett, köztük a Renault-t is, hiszen nekik csak a győzelem lenne elfogadható a vasárnapi versenyen.

Hat perccel a leintés előtt a Williams német versenyzője, Nico Rosberg felugrott a két Schumacher mögé a harmadik helyre. A köridők folyamatosan javultak, ami annak is köszönhető, hogy a csapatok egyre jobban tökéletesíteni tudták autóik beállításait a száraz pályára.

Nem sokkal az edzés vége előtt Jenson Button is villantott és felugrott a második helyre, míg Nick Heidfeld megkaparintotta a harmadik pozíciót a BMW-vel. Michael Schumacher a végén még futott egy parádés kört, és 1:30.653-as idejével magabiztosan átvette a vezetést.

Japán Nagydíj - Harmadik szabadedzés:

Poz. Pilóta        Csapat                   Idő                Kör

 1.  M.Schumacher  Ferrari             (B)  1:30.653           13
 2.  R.Schumacher  Toyota              (B)  1:31.863 + 1.210   15
 3.  Button        Honda               (M)  1:32.310 + 1.657   12
 4.  Fisichella    Renault             (M)  1:32.527 + 1.874   13
 5.  Alonso        Renault             (M)  1:32.555 + 1.902   14
 6.  Heidfeld      BMW-Sauber          (M)  1:32.590 + 1.937   15
 7.  Rosberg       Williams-Cosworth   (B)  1:32.730 + 2.077   18
 8.  Raikkonen     McLaren-Mercedes    (M)  1:32.730 + 2.077   12
 9.  Kubica        BMW-Sauber          (M)  1:32.787 + 2.134   17
10.  Massa         Ferrari             (B)  1:32.790 + 2.137   15
11.  Liuzzi        Toro Rosso-Cosworth (M)  1:32.977 + 2.324   20
12.  de la Rosa    McLaren-Mercedes    (M)  1:33.163 + 2.510   12
13.  Speed         Toro Rosso-Cosworth (M)  1:33.213 + 2.560   20
14.  Albers        Spyker MF1-Toyota   (B)  1:33.270 + 2.617   23
15.  Webber        Williams-Cosworth   (B)  1:33.339 + 2.686   17
16.  Coulthard     Red Bull-Ferrari    (M)  1:33.451 + 2.798   16
17.  Doornbos      Red Bull-Ferrari    (M)  1:33.663 + 3.010   12
18.  Barrichello   Honda               (M)  1:33.748 + 3.095   16
19.  Monteiro      Spyker MF1-Toyota   (B)  1:33.824 + 3.171   19
20.  Trulli        Toyota              (B)  1:34.118 + 3.465   15
21.  Yamamoto      Super Aguri-Honda   (B)  1:34.646 + 3.993   10
22.  Sato          Super Aguri-Honda   (B)  1:34.727 + 4.074   20

Az eredmények nem hivatalosak